Pour pouvoir répondre aux attentes de tous les étudiants, l'UNEF s'organise autour de commissions qui balyent toutes les préoccupations des étudiants. L'objet de ces commissions est la production d'une réflexion, la proposition d'initiatives et le suivi des dossiers, en rapport avec le thème.

> LA COMMISSION AIDE SOCIALE
Elle s'occupe de la réflexion autour du système des aides sociales, qu'elles soient gérées par le CROUS ou d'autres organismes : bourses, restauration, logements...

> LA COMMISSION UNIVERSITAIRE
Elle traite des questions pédagogiques, fait le suivi des réformes en cours et propose un certain nombre d'outils pour les élus étudiants en conseils d'université. C'est cette commission qui s'occupe également de toutes les questions d'insertion professionnelle.

> LA COMMISSION INTERNATIONALE
Elle suit ce qu'il se passe dans les autres pays d'Europe et du monde en matière d'enseignement supérieur.

> LA COMMISSION ÉTUDIANTS ÉTRANGERS
Elle porte une réflexion nécessaire sur les problèmes spécifiques des étudiants étrangers, organise des permanences juridiques et assure le lien avec les organisations d'étudiants étrangers.

La solidarité est pour l'UNEF, en tant que syndicat, une valeur essentielle. C'est pourquoi la défense des étudiants étrangers a toujours constitué une préoccupation majeure pour les militants de l'UNEF.  Ainsi, la commission Étudiants Étrangers a pour objectifs d'aider les étudiants étrangers dans leurs démarches de régularisation et de promouvoir la richesse culturelle que constitue la présence de toutes les nationalités au sein de l'Université. Pour cela des permanences juridiques sont tenues par les militants à notre local à la fac de Lettres et au bureau national et un travail, en constant développement, avec les associations d'étudiants étrangers s'approfondit de jour en jour.

> LA COMMISSION COMMUNICATION

Elle s'occupe de la communication externe et interne de l'organisation : la presse, les publications de l'UNEF, le site internet etc. Elle réalise également Étudiants de France, le journal de l'UNEF, qui fait le point sur l'actualité universitaire et sur la vie de l'UNEF.

> LA COMMISSION QUESTIONS DE SOCIÉTÉ

Elle s'occupe de l'ensemble  des sujets qui concernent l'université de manière indirecte. Elle mène un travail spécifique sur les facs sur des sujets aussi variés que la lutte contre les discriminations, la lutte contre l'homophobie, la laïcité, les droits des femmes...

> L'UNION DES COOPÉRATIVES ÉTUDIANTES DE FRANCE (UCEF)

Parce que l'UNEF fait le constat des difficultés sociales des étudiants sur les facs, en attendant les réponses des pouvoirs public, nous mettons en place des moyens d'organiser la solidarité sur les facs. Cela passe notament par l'organisation de bourses aux livres ou la gestion des coopératives.

> LA COMMISSION PROVINCE ET LA COMMISSION RÉGION PARISIENNE

Afin de pouvoir apporter des réponses adaptées aux étudiants dans tous les établissements d'enseignement supérieur, ces deux commissions sont chargées du développement et de l'aide aux structures locales. Elles recensent les différents problèmes de tous les établissements d'enseignement supérieur de France.